Bangunan Masjid yang awal hancur pada abad ke-14 dan aula doa dibangun kembali dengan enam kubahnya. Kubah menarik perhatian dengan ubin eksteriornya. Bangunan ini adalah salah satu contoh tertua dari masjid multi-kubah di Anatolia. Skema rencana masjid berbentuk persegi panjang dan bangunannya memiliki gaya dekorasi polos. Atap ini dibawa oleh 12 kolom yang memiliki kepala kolom kuno. Dinding luar masjid dibangun oleh batu pahat.
Masjid ini terkenal dengan menara masjidnya yang dibangun atas perintah Alaaddin Keykubad I, Sultan Seljuks yang memerintah antara 1220 dan 1237. Menara setinggi 38 meter itu adalah contoh unik Arsitektur Turki Anatolian. Ia berdiri di atas sebuah batu besar persegi yang berukuran 6,5 meter dan lebar 5,5 meter. Delapan poros bata merah berulir yang semi-melingkar dari Minaret awalnya dihiasi dengan ubin berwarna biru tua dan pirus berwarna.
Masjid Minaret Yivli mewakili desain arsitektur yang unik dengan menara bergalurnya. Hal ini dimungkinkan untuk membandingkan dengan menara serupa lainnya di Anatolia seperti menara Masjid Afyon Gedik Ahmet Paşa, Masjid Minaret Amasya Burmalı, Masjid Tirus Karahasan dan salah satu menara Masjid Edirne Üç Şerefeli. Tapi Masjid Minaret Yivli membedakannya dari mereka dengan bentuk dan desain minarnya yang belum pernah ada sebelumnya.
Menara itu dipulihkan pada tahun 1953 dan 1961 oleh Direktorat Jenderal Warisan Budaya dan Museum. Dan pada tahun 1973 Puncak menara ini diperbaharui kembali.